读音词义不同
从字面来看，“藩篱”与“樊篱”的区别在于“藩”和“樊”：“藩”读音是fān，“樊”的读音fán；二者相同点是都有“篱笆”之意；不同点是“藩”还有“屏障”的意思，“樊”还有“关鸟兽的.笼子”的意思。“藩篱”一词在《辞海》（上海辞书出版社版本）中被释为①用竹木编成的篱笆或围栅。如《南史·韦传》：“所至顿舍，修立馆宇，藩篱墉壁，皆应准绳。”亦作“蕃篱”。贾谊《过秦论上》：“乃使蒙恬北筑长城而守藩篱。”此引申为屏障之义。庚信《哀江南赋序》：“江淮无涯岸之阻，亭壁无藩篱之固。”②比喻艺术境界。如蔡宽夫《诗话》：“王荆公晚年亦喜称义山诗，以为知学老杜而得其藩篱，惟义山一人而已。”
“樊篱”在《现代汉语词典》中解释为：篱笆，比喻对事物的限制。如冲破旧礼教的樊篱。
对以上释义有例句进行分析，我们可以得出这样的词义差别：“藩篱”是指具体的、感性的、形象的客观存在的实物“篱笆”的门户或屏障；“樊篱”是指概括的、理性的、抽象的主观能动（一般多指思想、观念方面）的虚物“篱笆”的限制和束缚。
感情色彩不同
“藩篱”一般情况下是中性词；“樊篱”多用在反面语境中，故贬义色彩强烈些。